《飛越瘋人院》改編自美國作家肯·克西的同名小說，影片講述了麥克·墨菲（以下簡稱麥克）帶領精神病院患者抗爭護士長瑞秋的故事。
麥克以一名疑似精神病患者的身份被送到了精神病院。他是一名罪犯。當他來到精神病院，看著解下的手銬時，充滿了喜悅。
而這家精神病院呢？這裡氣氛和諧，很適合養病。吃藥治療的時候病院裡放著輕快的音樂。病人們可以在醫院裡四處活動，打牌抽菸。看起來一片和諧，其實，只是假象。他們是沒有真正的自由的。
當音樂聲太大，影響他們之間交流，麥克要求調低音樂聲的時候，被殘忍地拒絕了。
在世界棒球錦標賽的比賽期間，他在每日例會中提出想在比賽期間改變一下日常作息制度。瑞秋讓大家舉手表決，少數服從多數。但例行會議中的9個病人只有3個人舉了手。這次投票，失敗告終。
第二天例行會議中，麥克提出了重新投票。這次9個人全部贊同更改作息制度。但瑞秋卻以病院裡有十八個病人而拒絕。最後，酋長舉起了手。瑞秋又以表決時間已經過去了，再一次拒絕了他的要求。
麥克曾經問大家，是不是被迫來到這裡的。結果發現，都是自願的。他很生氣地質問：你們一直抱怨這個地方如何難以忍受……但是你們沒有勇氣走出這裡。其實，我們又何嘗不是這樣呢？總是抱怨，又呆在舒適區不願意有什麼變動。於是，溫水煮青蛙，不死不活地活著。
某天的自由活動時間，麥克想出海釣魚，就逃出去帶領大家去兜風釣魚。結果每個人都玩得很盡興，一點也不像精神病患者。但回來後，麥克受到了懲罰。
一次例會中，有個病人激動地對護士長說他要煙，要他自己家人帶給他的煙，護士長卻說，因為麥克在醫院裡開了個小型賭場，從而將病人們的福利都給暫停了。聽到這個消息後，這個病人大鬧了起來。事後，他們被送到電療室進行電療。在這個病人被強迫帶去後，麥克發現酋長原來可以說話，是一個正常人。麥克高興極了，隨即提議酋長跟他一起逃跑。
聖誕節之夜，麥克給所有的病人組織了一次離別前的狂歡。聖誕節第二天，瑞秋在病房裡發現了比利和凱蒂在做一些男女之事。她威脅說要告訴他母親，然後，比利自殺了。
麥克也受到了更嚴厲的懲罰，他被施加額葉切除手術。酋長不願看到這個行屍走肉一樣的麥克，就把他殺了。然後，搬起了洗手臺，砸向窗戶，飛越了瘋人院 。
有個細節讓我深受觸動。麥克和大家打賭說，我可以把洗手臺舉起來，當時周圍的人都不相信。於是，他試著搬動它，但是沒有成功。他說：至少我試過了。是的，哪怕失敗，也要試一試。不然，怎麼知道行不行呢。