我國科學家揭示環狀RNA在預測II/III期結腸癌患者復發風險預測中的...

2020-12-01 生物谷

 

結腸癌是常見的發生於結腸部位的消化道惡性腫瘤，發病率佔胃腸道腫瘤的第3位。約60%患者初次診斷時已發展為局部晚期（II/III期），即使手術順利切除後仍有20-30%的復發風險。因此，對II/III期結腸癌患者的精確風險分層是術後治療策略的關鍵所在。目前的分期方法在預測II/III期結腸癌患者的復發風險方面有一定的局限。環狀RNA（circRNA）是一種新型的非編碼RNA，伴隨高通量測序技術的發展和進步，越來越多的環狀RNA被證實參與多種生物學功能，影響腫瘤的發生發展。同時，由於其特殊的封閉環狀結構，不易被核酸外切酶降解，具有成為腫瘤患者生存相關標記物的潛能。

2019年9月2日，中山大學附屬腫瘤醫院徐瑞華團隊在EMBO Molecular Medicine雜誌上發表了題為「A Circrna Signature Predicts Postoperative Recurrence in Stage II/III Colon Cancer」的研究工作，該研究揭示了環狀RNA在預測II/III期結腸癌患者復發風險預測中的重要作用，為結腸癌術後的精準治療提供了更好的治療策略。

該研究團隊採用高通量轉錄組測序技術與LASSO篩選框架的機器學習方法相結合。通過比較20例（復發和未復發各10例）II/III期結腸癌組織標本，分析並鑑定出差異表達的100個環狀RNA，並應用qRT-PCR方法在96例（復發和未復發各48例）驗證出22個顯著高表達的環狀RNA。該團隊進一步結合列線圖（Nomogram）數據挖掘方法，利用大樣本的II/III期結腸癌患者隊列（訓練集，249例；內部驗證集，122例；外部驗證集，180例），最終構建出一組基於4個環狀RNA（hsa_circ_0122319、hsa_circ_0008039、hsa_circ_0079480和hsa_circ_0087391）的分子指標模型（cirScore）。該分子指標模型預測II/III期結腸癌復發風險的準確性顯著高於傳統的臨床病理分期。研究首次揭示了一組由環狀RNA組成的分子指標在中期結腸癌復發風險預測中的重要作用，同時開創了基於機器學習的結腸癌分子標記物篩選新方法，為結腸癌的精準診療提供了新的思路和新的方法。 (生物谷Bioon.com）

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