染色和標記是細胞生物學研究常用方法。早在螢光蛋白發現之前,免疫偶聯螢光標記、化學螢光染料直接標記等技術已廣泛應用於生物分子的研究中。而螢光蛋白的發現及後續改造,為生命科學基礎研究提供了更為完善和系統的標記工具,為探索活細胞中微觀生命的活動規律創造了機會,推動了人們對生命進一步的認識。
1螢光蛋白的發現及分類
1.1綠色螢光蛋白
1962年,下村修從維多利亞多管水母中分離到一種蛋白,在紫外線激發下它可以發出綠色螢光,即綠色螢光蛋白(GFP)。他還採用生物化學方法初步推測了GFP的發光位點和發光基團。
普拉舍於1985至1992年間完成了GFP基因和蛋白質序列的測定,並確定了發光位點。隨後科學家解析了GFP的晶體結構。首次將GFP應用於生物學研究的是馬丁·查爾菲,他通過分子生物學技術將GFP的cDNA在線蟲等模式生物中表達,使人們意識到GFP作為報告基因的巨大潛力。錢永健團隊解析了GFP的發光機制,並通過突變對GFP改造,得到了一些螢光亮度更高、吸收峰單一、構象摺疊效率高的突變體,如GFP-S65T。為了表彰他們在綠色螢光蛋白研究中做出的巨大貢獻,2008年諾貝爾化學獎授予了下村修、馬丁·查爾菲和錢永健三位科學家。
1.2紅色螢光蛋白
1999年,Matz等從珊瑚蟲中分離出了能在紫外照射下發出紅色螢光的蛋白質——紅色螢光蛋白(RFP)。其中,DsRed是最早用於研究的紅色螢光蛋白,2001年Yarbrough等人解析了它的晶體結構。相比於GFP,它有更高的螢光強度,成像背景低,並能激發和發射更長的波長。很多時候,研究者可同時使用GFP和DsRed對不同蛋白質進行雙標記可完成GFP無法獨自解決的問題。但DsRed在應用中也因成環氧化過程緩慢、易寡聚化等缺陷,限制了其在一些研究中的應用。隨後科研人員對其進行一系列的遺傳改造,使其成為真正意義上的RFP。
1.3其他類型的螢光蛋白
為了擴大螢光蛋白的用途,科研人員基於光譜特性作了進一步的改造,得到了不同顏色的突變體。例如,突變GFP獲得了藍色(BFP)、青色(CFP)、綠色(GFP)和黃綠色(YFP)四組不同顏色的螢光蛋白,其光譜範圍覆蓋藍色至黃色。RFP突變衍生出了橙色、紅色和近紅外光譜的螢光蛋白。以上變種的光譜幾乎覆蓋了可見光範圍,極大地提高了螢光蛋白標記選擇的靈活性。此外,隨著人們對螢光蛋白的不斷研究,科研人員又從其他物種分離了各種螢光蛋白,發現它們會因物種的不同在結構、性質和發光機制上也有所差異。
2螢光蛋白的理化性質
GFP是由238個胺基酸組成的分子量約為27kD的單體蛋白。其二級結構是11條β摺疊鏈組成的圓柱體狀,還有一條α螺旋鏈沿圓柱體中軸分布,我們稱之為β罐。GFP能產生螢光是因為內部的絲氨酸-酪氨酸-甘氨酸(第65~67位胺基酸殘基)形成了生色團,該生色團位於圓柱體中心的α螺旋上,為自己創造了一個穩定的環境。生色團內的分子可環化形成對羥基亞苄基咪唑啉酮,這種化學鍵能被激發發光。該過程是自動催化完成的,不需要底物和其他蛋白質的修飾,唯一需要氧氣作為輔助因子參與化學鍵形成時的脫氫反應。
DsRed是由225個胺基酸組成,分子量約為26kD的蛋白質。與GFP相比,兩者在一級結構上同源性很低,但二級結構的相似度很高,也能形成β罐。其生色團是由穀氨醯胺-酪氨酸-甘氨酸(第66~68位胺基酸殘基)組成。生色團的形成兩者也有差異,DsRed會先形成類似於GFP的生色團中間體,再經氧化反應,才轉為紅色螢光生色團。總的來看,DsRed的生色團是GFP生色團的延伸。
3螢光蛋白的應用
由於螢光蛋白的眾多優點,使其廣泛應用於生物學的多個領域。
3.1蛋白質定位和功能研究中的應用
螢光標記和示蹤是螢光蛋白最基本的功能,也是目前細胞生物學研究的重要手段。例如,研究一種蛋白質在細胞中的分布時,可將目的蛋白基因和螢光蛋白基因融合到同一質粒中,構建融合基因表達載體,並轉染至細胞內,表達的融合蛋白能行使目的蛋白的生物學功能,又有螢光蛋白的發光特點。隨後藉助雷射共聚焦顯微鏡分析目的蛋白的亞細胞定位。此外,上述融合表達載體還可用於啟動子分析、基因表達調控等的研究。
3.2蛋白質互作研究中的應用
蛋白質互作是生命現象發生的基礎,研究其互作可以闡明生物反應的機理,揭示生命現象的本質。目前,基於螢光蛋白的螢光共振能量轉移(FRET)技術和螢光互補(FC)技術已成為研究蛋白互作的有效手段。以FRET技術為例,FRET現象涉及兩種螢光蛋白,分別作供體和受體,要求供體的發射譜與受體的吸收譜重疊,當兩者距離很近時(1~10nm),光子能量將從供體轉移至受體,使受體發出螢光。目前,最常用的一對供受體是基於GFP突變的青色螢光蛋白(CFP)和黃色螢光蛋白(YFP)。例如,研究a、b兩種蛋白質間是否互作,就可以將CFP基因和YFP基因分別與編碼a、b蛋白的基因融合到同一質粒,並在同一細胞中表達。如果a、b蛋白發生互作,CFP和YFP也會因a、b蛋白構象的改變而靠得很近,從而發生FRET現象。此時就能檢測到YFP發射的螢光,而CFP發射的螢光會大大減弱甚至消失。
——王裕鵬.簡述螢光蛋白[J].生物學教學,2019,44(05):73-74.