1月7日，《自然·通訊》發表了中國科學院微生物研究所的科學家團隊完成的小鼠腸道微生物資源庫工作。
腸道微生物是近年來生命科學和健康領域研究的前沿和熱點。越來越多的證據表明，腸道微生物與宿主健康和生長發育密切相關，在未來人體健康管理和醫療產業發展中，具有十分重要的作用。腸道微生物資源庫的建設，是開發利用腸道微生物的基礎，是認知宿主—微生物互作機制和開發微生物藥物的關鍵。
此次報導的小鼠腸道微生物資源庫包括126種微生物及其基因組。其中77種微生物是首次成功分離培養的新物種，並對其進行了分類學鑑定和命名，這些新物種的發現和鑑定，大幅度提高了對於小鼠腸道菌群高通量16S rRNA擴增子測序數據的物種注釋比例。該小鼠菌株資源庫覆蓋了超過88%小鼠腸道的核心屬，其基因組代表了超過52%的小鼠腸道微生物的非冗餘功能基因集。該資源庫的構建使得可培養的小鼠腸道微生物菌株資源從48個屬增加到110個屬、從76種增加到180種，為後續基於小鼠模型開展腸道菌-宿主互作機理研究和功能菌株開發奠定了資源基礎。我們前期利用該資源庫中的一株狄氏副擬桿菌開展了腸道菌群與宿主互作的研究，發現狄氏副擬桿菌通過產生琥珀酸、次級膽酸來激活不同的信號通路，發揮多靶點整體調節作用，是一種潛在的、新型抗代謝症候群益生菌 (Wang et al. 2019. Cell Rep.)。
該項工作由中國科學院微生物研究所劉暢博士等人完成，劉雙江研究員和劉宏偉研究員為文章通訊作者。該項工作歷時二年多，得到了中國科學院微生物組計劃項目和國家自然科學基金項目的支持。