這幾年,腸道微生物成為了奇點糕這裡的「常客」,每隔些日子就要被拉出來說一說,但也不是奇點糕非要這樣,實在是它們太神通廣大了,從方方面面影響我們的健康。
是的,今天還是腸道微生物的主場,這一次,我們要說說它是如何影響晝夜節律,調節代謝和肥胖的。
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在今天的《科學》雜誌上,美國德克薩斯大學西南醫學中心的研究人員在他們的研究中發現,食物代謝、脂質吸收的晝夜節律竟然是由腸道微生物來設定的!腸道微生物的失調或是晝夜節律被打破,代謝也會隨之受到影響。不但如此,他們還揭示了其中的表觀遺傳學機制[1]。
一般來說,我們都會覺得,應該是腸道微生物對食物的代謝遵循基因設定的晝夜節律,但這一次,情況剛好反過來了。
代謝過程相關基因表達的節律是如何產生的?其中的關鍵點在於染色質的組蛋白修飾[2,3]。而研究人員進行的小鼠實驗表明,在普通小鼠的小腸上皮細胞中,兩個組蛋白乙醯化標誌物和小鼠表現出同步的晝夜節律。而在無菌小鼠中,雖然兩個標誌物的水平也有高低波動,但晝夜節律的幅度降低,且峰值不像普通小鼠一樣固定。
普通小鼠(CV)和無菌小鼠(GF)兩個標誌物的晝夜節律
在正常的晝夜節律中,與代謝過程相關基因的表達,像營養物質運輸和脂質代謝,都在組蛋白乙醯化峰值附近達到峰值,表達水平的起伏振蕩也與晝夜節律相吻合。
由此可見,腸道微生物驅動了小腸中組蛋白乙醯化與晝夜節律的同步變化,並且可能調節代謝過程。
接下來,研究人員探究了腸道微生物是如何驅動組蛋白乙醯化的節律的。他們找到了一個名為組蛋白脫乙醯基酶3(HDAC3)的蛋白質,沒有這個酶,小鼠就算狂吃高脂食品也不會變胖。這說明,HDAC3可能是腸道微生物驅動組蛋白乙醯化節律的關鍵分子。
光聽HDAC3這個名字,也能猜到它大概是如何工作的,對,它能夠從組蛋白中把乙醯基剝下來。為什麼要剝下來呢?因為在細胞中,組蛋白就像一個繞線器,DNA在它上面纏繞,給組蛋白加上乙醯基,或者減少乙醯基,能夠調節DNA纏繞的緊密程度,過緊的DNA纏繞很難去開啟基因的表達。
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在普通小鼠中,組蛋白的乙醯化和脫乙醯化在一天中有規律的循環,而無菌小鼠中這種規律就不那麼明顯。
抑制了小腸上皮細胞的HDAC3表達後,研究人員發現,幾個具有晝夜節律的營養成分運輸蛋白的基因,包括運輸酪氨酸、肌醇和核黃素的基因,它們表達也受到了抑制,這些成分在血清中濃度變化的節律也不明顯了。
除了這幾種營養成分,脂質代謝相關的基因也在缺少HDAC3的小鼠中表現出了紊亂的晝夜節律。在這些基因中有17個的表達增加,它們普遍參與脂質的生物合成和脂肪酸的β-氧化,還有18個基因表達減少,其中有一個Cd36基因,它編碼脂肪酸轉運蛋白,促進小腸上皮細胞吸收脂質。所以,小腸上皮細胞中缺少HDAC3的小鼠才會怎麼餵高脂飲食都胖不起來。
研究到這裡還沒有結束,HDAC3是通過誰來開啟Cd36,促進脂質吸收的呢?研究人員對Cd36這個基因進行了研究,他們發現,HDAC3是直接調節Cd36表達的,不通過組蛋白乙醯化這條路。
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利用染色質免疫共沉澱的方法,研究人員在脂肪組織中發現,HDAC3和雌激素相關受體α(ERRα)在多個Cd36基因的啟動子和增強子位點大量存在,它們兩個相互作用,共同來激活Cd36基因。
也就是說,腸道微生物誘導了小腸上皮細胞中HDAC3的節律性表達,HDAC3調節日常的營養攝取和脂質吸收。所以,如果腸道微生物失調,或是因為熬夜等原因幹擾了晝夜節律,代謝功能也會隨之紊亂,導致攝入的脂肪更多,從而出現肥胖。
不過這項研究也還有一些問題沒有解決,比如說,腸道微生物是如何調控HDAC3的?是它們自己分泌的一些蛋白質或小分子?還是通過腸道上皮細胞?
研究人員表示,這是一個複雜且龐大的系統,他們很難在一個研究中把這些問題都解釋清楚,這是以後的研究需要繼續努力的。如果這個結果也能在人的身上得到驗證,那麼或許有一天,研究人員能夠開發出抵消熬夜或是夜班工作對代謝的副作用的藥物,來避免肥胖[4]。
編輯神叨叨
做人太難了……
參考資料:
[1] https://science.sciencemag.org/content/365/6460/1428
[2]Doi M, Hirayama J, Sassone-Corsi P. Circadian regulator CLOCK is a histone acetyltransferase[J]. Cell, 2006, 125(3): 497-508.
[3]Mehra A, Baker C L, Loros J J, et al. Post-translational modifications in circadian rhythms[J]. Trends in biochemical sciences, 2009, 34(10): 483-490.
[4] https://www.sciencenews.org/article/mouse-metabolism-may-follow-circadian-rhythms-set-gut-bacteria
本文作者 | 應雨妍