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科學家揭示葉酸代謝與轉錄調控之間的聯繫
科學家揭示葉酸代謝與轉錄調控之間的聯繫 作者:小柯機器人 發布時間:2019/7/7 11:10:13 奧地利科學院分子醫學CeMM研究中心Stefan Kubicek團隊近日取得一項新成果。
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基因轉錄調控:共激活因子的多樣性及調控機制
Roeder教授首先發現了真核生物RNA聚合酶I、II、III,從而開創了真核生物轉錄調控領域。隨後Roeder實驗室採用生物化學方法建立了體外轉錄系統,並利用該系統分離和鑑定了眾多關鍵轉錄調控因子,其中包括第一個真核轉錄因子TFIIIA、中介體複合物(mediator)以及多種通用轉錄因子(GTFs),並且揭示了染色質結構(包括組蛋白修飾)在表觀遺傳水平對基因轉錄的影響。
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資料庫 | 怎樣查詢調控circRNA的轉錄因子
越來越多的研究揭示了一些環形RNA可以通過不同的分子機制參與到細胞或個體正常的生命活動中,包括miRNA和蛋白質的分子海綿、影響RNA轉錄、幹擾RNA前體的正常剪接,甚至可以通過翻譯產生多肽等。儘管大部分環形RNA的功能不詳,但目前circRNA研究都主要集中在對miRNA和mRNA/lncRNA,以及蛋白質的功能調控方面。
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轉錄調控搞不懂?來看看這些綜述吧!(含下載連結)
轉錄調控涉及到的生物學過程非常廣泛,從甲基化到泛素化,從可變剪切到DNA修復,從免疫反應到自噬,都能和轉錄調控扯上關係。同樣的,由於轉錄調控的負責人轉錄因子出了問題而引發的疾病也是各種各樣。所以,轉錄調控的機制在課題設計和科學研究中常常作為一個萬金油的選擇,用轉錄調控來連接上下遊是非常常見的手法。但是,轉錄調控的機制真有你考慮的那麼簡單麼?特異性有那麼高麼?
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研究揭示出一類新的細菌轉錄調控因子的結構功能機制
近年來,在一些梭菌和桿菌中發現一類廣泛存在的σ因子及其共轉錄的抗σ因子——SigI和RsgI,它們的一些結構域和已知蛋白沒有同源性,代表了一類新的特殊的細菌σ/抗σ因子。熱纖梭菌等一些產纖維小體細菌具有8-16對的SigI/RsgI因子,這在其他已知類型的σ/抗σ因子中比較少見。已有的研究表明這些SigI/RsgI因子負責纖維小體的調控表達,但其結構與功能機制仍未闡明。
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南京農業大學揭示一種MYB轉錄因子調控杜梨耐寒性的作用機制
之前的研究發現了與AtDHAR(脫氫抗壞血酸還原酶,dehydroascorbate reductase)相關的應激反應基因,AtDHAR2參與提高鹽和低溫脅迫的抗性,而進一步鑑定其轉錄因子(transcription factor,TF)及其對相關基因表達和蛋白水平變化的作用非常重要。 植物體內含有多種不同的TF,其中MYB是最大的TF家族之一,佔TF總數的約9%。
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Nat Comm|鄧新/嚴健合作揭示丁香假單胞菌轉錄調控網絡
轉錄因子作為調控基因表達的關鍵元件,在轉錄調控介導的生物學過程中起著重要作用。先前國內外研究人員已經發現一些控制丁香假單胞菌致病性的轉錄因子,但缺乏一個全基因組水平的轉錄調控網絡,這對全面防治該類病害的大規模暴發產生了很大障礙。
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數學院等通過調控網絡數學建模揭示幹細胞分化關鍵轉錄因子
數學院等通過調控網絡數學建模揭示幹細胞分化關鍵轉錄因子 2019-03-01 數學與系統科學研究院 這一成果提出了利用匹配的基因表達和染色質可及性數據刻畫轉錄因子和調控元件結合調控下遊基因表達的數學模型,構建了描繪細胞狀態轉化的染色質調控網絡,通過網絡分析鑑定出TFAP2C和p63分別為表面外胚層起始和角質形成細胞成熟的關鍵因子,並揭示了譜系定型過程中TFAP2C-p63對表觀遺傳轉換的反饋調節機制。
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研究揭示轉錄因子NIN在根瘤菌侵染時的關鍵作用
英國約翰·英納斯中心植物和微生物科學聯合研究中心(Center of Excellence for Plant and Microbial Sciences; CEPAMS)Jeremy Murray研究組題為NIN acts as a Network Hub Controlling a Growth Module Required for Rhizobial Infection 的研究論文,該文揭示了轉錄因子
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【科技前沿】張宏團隊揭示自噬調控新機制:IPMK通過抑制轉錄因子...
相分離形成的凝聚體起到分隔細胞組分的作用,從而在空間上保證了不同的細胞功能高效、有序的進行。近年研究發現,轉錄因子、轉錄中介體Mediator和RNA聚合酶等轉錄組份通過液-液相分離形成轉錄凝聚體(transcriptional condensates),激活下遊基因轉錄【1-3】。但是當沒有受到轉錄信號刺激時,這些液-液相分離的轉錄因子與其他轉錄組分之間的相互作用是如何被調控的尚未被闡明。
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EMBO Reports:果蠅揭示腸癌中關鍵性轉錄因子
2014年10月9日訊 /生物谷BIOON/ 近日,西班牙研究人員弄清楚了一種稱為Mirror的轉錄因子是如何調節果蠅腸道中腫瘤樣生長的。相關研究結果發表在EMBO Reports雜誌上。
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生命科學學院蘇曉東實驗室揭示茉莉酸信號通路中轉錄因子調控新機制
5月16日,北京大學生命科學學院蘇曉東實驗室在Cell子刊Cell Reports雜誌上發表題為「Crystal Structure of tetrameric Arabidopsis MYC2 reveals the mechanism of enhanced interaction with DNA」的研究論文,文章解析了植物中首個basic Helix-loop-Helix(bHLH)家族的轉錄因子
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研究揭示影響轉錄後調控的體細胞同義突變在癌症發生中的作用
該研究首次揭示了影響轉錄後調控的體細胞同義突變在癌症基因組中的分布特徵和臨床相關性,強調了在癌症生物學研究中考慮影響轉錄後調控的同義突變的重要性。 體細胞同義突變是癌症基因組編碼區中最常見的變異之一。孫中生研究團隊最近發現,同義突變可以通過改變RNA剪接、RNA穩定性和蛋白質翻譯來驅動癌症發生,提示這些「沉默」突變存在未被發現的調控作用。
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細菌ClassIII轉錄因子CueR轉錄激活的分子機制被揭示
大約50年前,法國著名科學家Jacob和Monod發現乳糖操縱子,首次提出基因表達受到蛋白調控在隨後的幾十年中,科學家們利用化學交聯、DNA足跡、遺傳突變等方法嘗試了解轉錄因子調控基因轉錄的具體機制,大家發現轉錄因子在啟動子DNA的結合位置直接決定了其對於下遊基因的影響,一般來講,轉錄因子結合在核心啟動子區域(-35區和-10區)上遊發揮轉錄激活功能,轉錄因子結合在核心啟動子區域或者基因內部則抑制轉錄。
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轉錄因子MYB10的作用
The Plant Cell雜誌發表了題為「Allelic花青素的合成在內質網上完成後,通過不同的轉運機制被轉運到液泡中予以貯存。MYB、bHLH和WD重複蛋白等轉錄因子能夠誘導或抑制花青素的生物合成。不同品種二倍體和八倍體草莓的果實顏色自然變異很大。花青素除了影響果實顏色,還具有抗氧化等功能,對人類健康也具有重要意義。問題哪些基因參與草莓果實顏色自然變異的調節?
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北京生科院揭示影響轉錄後調控的體細胞同義突變在癌症發生中的作用
該研究首次揭示了影響轉錄後調控的體細胞同義突變在癌症基因組中的分布特徵和臨床相關性,強調了在癌症生物學研究中考慮影響轉錄後調控的同義突變的重要性。 體細胞同義突變是癌症基因組編碼區中最常見的變異之一。
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Nature Chem Biol | 張餘研究組揭示細菌ClassIII轉錄因子CueR轉錄...
大約50年前,法國著名科學家Jacob和Monod發現乳糖操縱子,首次提出基因表達受到蛋白調控。在隨後的幾十年中,科學家們利用化學交聯、DNA足跡、遺傳突變等方法嘗試了解轉錄因子調控基因轉錄的具體機制,大家發現轉錄因子在啟動子DNA的結合位置直接決定了其對於下遊基因的影響,一般來講,轉錄因子結合在核心啟動子區域(-35區和-10區)上遊發揮轉錄激活功能,轉錄因子結合在核心啟動子區域或者基因內部則抑制轉錄。
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揭示先鋒轉錄因子在細胞凋亡表觀遺傳中的關鍵作用 | Cell Research
fate 期刊:Cell Research 作者:Rui Gao, Xingqun Liang, Sirisha Cheedipudi, Julio Cordero, Xue Jiang, Qingquan Zhang, Luca Caputo, Stefan Günther, Carsten Kuenne, Yonggang
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轉錄因子調控水稻細胞壁合成機理研究獲進展
轉錄因子是水稻農藝性狀形成的一類重要調控因素,涉及產量、株高、生育期等,但如何影響水稻細胞壁的合成鮮有報導。近期研究團隊從反向遺傳學途徑,利用酵母單雜技術,對調控水稻細胞壁纖維素合成的轉錄因子OsMYB61進行文庫篩選,獲得NAC家族的一個轉錄因子OsSND2,研究表明OsSND2能夠結合OsMYB61的啟動子,調控OsMYB61的功能表達,影響纖維素的合成,從而導致細胞壁的結構變異。
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重慶大學李正國團隊揭示番茄果實成熟轉錄調控新機制
The Plant Journal 重慶大學李正國團隊揭示番茄果實成熟轉錄調控新機制責編 | 奕梵通過對番茄果實成熟突變體的研究,現已鑑定出了多個調控果實成熟的基因。乙烯作為一種重要的植物激素,在呼吸躍變型果實(番茄、蘋果、香蕉等)的成熟過程中發揮關鍵調控作用。目前報導較多的果實成熟調控基因多為正調控因子,且很多基因的作用機制仍不清楚。