2020年3月28日訊/
生物谷BIOON/---蛋白在細胞中執行特定任務，但是對蛋白活動的時間控制是至關重要的。當蛋白完成它們的任務時，它們就會被降解。為了進行時間控制，一種稱為泛素的標記被附著到不需要的蛋白上，從而使得它們隨後遭受降解。儘管將泛素附著到靶蛋白上的複雜分子機器是已知的，但這些分子機器如何進行這種標記過程尚不清楚。
在一項新的研究中，來自德國馬克斯普朗克生化研究所和美國內華達大學拉斯維加斯分校的研究人員合作揭示了這些分子機器，相關研究結果近期發表在Nature期刊上，論文標題為「NEDD8 nucleates a multivalent cullin–RING–UBE2D ubiquitin ligation assembly」。
圖片來自Kheewoong Baek/MPI of Biochemistry。
諸如免疫應答或細胞增殖之類的許多細胞過程取決於許多不同的蛋白按照一定的次序發揮作用。為了讓細胞正常運行，蛋白必須在完成它們的工作後受到降解。當引起疾病的突變阻止蛋白及時降解時，蛋白可能會在錯誤的時間起作用，這可導致包括癌症、心臟病和發育障礙在內的疾病。
控制蛋白降解細胞利用泛素對不需要的蛋白進行標記以便它們隨後受到降解。這種稱為泛素化的標記過程是通過稱為E3連接酶的分子機器進行的。重要的是，E3連接酶本身要在細胞中正確的位置和正確的時間被開啟和關閉。在所有E3連接酶中，它們的開啟開關（on-switch）中的大約三分之一是一種類似於泛素的小蛋白，即NEDD8。
NEDD8控制對其他蛋白的關閉儘管這些蛋白降解機器的各個組成部分是已知的，但尚不清楚NEDD8如何開啟E3連接酶並能夠用泛素標記靶蛋白。論文通訊作者、馬克斯普朗克生化研究所分子機器與信號轉導系主任Brenda Schulman說，「這尤其重要，這是因為抗癌
臨床試驗中有阻斷NEDD8的藥物，並且某些傳染性
細菌會操縱NEDD8來幹擾細胞過程。」
Schulman和她的團隊如今破譯了這種泛素化的分子機制。Schulman說，「我們研究了NEDD8開啟E3連接酶的作用方式。我們發現NEDD8如何誘導E3分子機器將泛素標記帶到它的靶標上。這是細胞中的蛋白不再需要時在適當的時間關閉它們的關鍵。」
通過使用化學技術和低溫電鏡技術，Schulman團隊成功地觀察到了在泛素化過程中一種重要的被NEDD8激活的E3連接酶。論文第一作者Kheewoong Baek解釋說，「為此，我們仔細研究了這種標記過程中的每個步驟。這種自然發生的過程在不到一秒鐘的時間內發生，此後這種分子標記機器會瓦解。捕獲這種通常短壽命狀態的過程尤其困難。」
E3連接酶分子機器控制許多細胞過程。Schulman說，「這個被破譯的機制不僅解釋了正常的過程和在某些因發生突變導致E3連接酶分子機器失效的癌症中什麼地方出錯了，而且還可以作為開發用泛素標記不想要蛋白的治療方法的指南。我們希望，從長遠來看，這可能幫助降解導致癌症的蛋白。」（生物谷 Bioon.com）
參考資料：1.Kheewoong Baek et al. NEDD8 nucleates a multivalent cullin–RING–UBE2D ubiquitin ligation assembly. Nature, 2020, doi:10.1038/s41586-020-2000-y.