| 小RNA研究獲重要進展 |
| 哺乳動物小RNA可降低目標信使RNA水平 |
哺乳動物小RNA可降低目標信使RNA水平。
本報訊 小核糖核酸（miRNA）研究領域中的一個最大問題便是搞清這些小型的RNA如何在動物體內抑制它們的信使RNA（mRNA）目標。早期的研究表明，miRNAs的活動減少了轉譯的效率，但對於目標mRNA的水平只有相對較小的影響。然而，來自美國科學家的新證據表明，就像在植物中一樣，miRNAs通過減少目標mRNA的水平而顯著發揮了它們對於哺乳動物細胞的影響。
麻薩諸塞州劍橋市懷特海德生物醫學研究所的Huili Guo、David Bartel和同事利用核糖體圖譜——基於mRNA片段深度測序的一種靈敏的方法——分析了miRNAs對其在人類和小鼠細胞中的靶點的影響。他們描述了轉染miRNA細胞和模擬轉染細胞，同時在每個樣本中完成了mRNA測序。這一策略使得研究人員能夠直接將mRNA上的核糖體密度與mRNA豐度進行比較，進而比較miRNA在一個特定時間點上對轉錄水平和轉錄效率的影響。
研究人員分析了向子宮頸癌細胞——miRNA在子宮頸癌細胞中缺乏正常的表達——中引入miR-1或miR-155的影響，以及在小鼠的嗜中性粒細胞中敲掉mir-223（一種內生表達的miRNA），此時這3種miRNA的影響已經被數千種細胞蛋白質所確定。miRNA似乎並沒有抑制目標mRNA，這意味著，miRNA的抑制效應獨立於目標的表達水平。
Bartel和同事於是鑑別出了一套被他們稱為「蛋白質組學支持目標」的目標mRNA，這是因為蛋白質組學分析表明，這些目標的蛋白質水平也存在一個巨大的變化。對於這一系列目標而言，研究人員發現了所有3種miRNA在轉染效率上適度但在統計學上具有意義的影響——約佔11%到16%的目標表達。這些結果意味著，至少84%的由miRNA調節的目標抑制是緣於mRNA水平的減少，這比之前利用陣列分析獲得的估計值要大。此外，研究人員的結果還表明，miRNAs對於其目標的蛋白質產出的影響能夠通過利用mRNA測序分析轉錄水平而加以評估。研究人員在最近出版的《自然》雜誌上報告了這一研究成果。
研究人員指出，下一步將是搞清這種轉錄擾動情況是否適用於其他細胞類型，以及確定miRNA擾亂其miRNA目標的根本機制。（群芳）
《科學時報》 (2010-11-29 A3 國際)