一般根據特殊面容、異常體徵、
智力低下可做出診斷，但上述特徵並非是先天愚型患兒所特有的，進一步確定診斷需要做染色
體檢查。Hall（1964）提出在以下10個體徵中具有6個以上時即可診斷：
①擁抱反射消失（陽性率為85％）；
②肌張力低（陽性率為80％）；
③面部扁平（陽性率為90％）；
④眼裂上斜（陽性率為80％）；
⑤耳發育不良（陽性率為60％）；
⑥頸後皮膚增厚（陽性率為80％）；
⑦通貫掌（陽性率為45％）；
⑧關節活動過度（陽性率為80％）；
⑨骨盆發育不良（陽性率為70％）；
⑩小指中指骨發育不良（陽性率為60％）。另外，產前診斷可以通過測母體甲胎蛋白、非結合雌三醇、絨毛膜促性腺激素，並結合母親妊娠時間進行篩查，可篩查出61％的先天愚型胎兒的妊娠。近年來發現，母血中尿素抗嗜中性白細胞鹼性磷酸酶活性增高，其陽性率為79％。確切的診斷需
羊水穿刺進行細胞
遺傳學檢查。